Platform Komputasi Berkinerja Tinggi Untuk Pipeline Pemodelan Molekuler

Hak Cipta

Platform Komputasi Berkinerja Tinggi Untuk Pipeline Pemodelan Molekuler

Hak cipta yang diusulkan pada dokumen ini berupa program komputer yang kami beri judul ‘Platform Komputasi Berkinerja Tinggi untuk Pipeline Pemodelan Molekular’. Proyek ini dikembangkan di dalam kegiatan riset yang didanai oleh Rumah Program Purwarupa Vaksin Untuk Pencegahan Dan Terapi Penyakit dari Organisasi Riset Kesehatan tahun anggaran 2024. Tujuan umum dari pengembangan platform ini adalah untuk mendukung dan mempermudah kegiatan penelitian tertentu yang melibatkan metode atau alat pemodelan molekuler. Sasaran dari platform ini adalah para periset di lingkungan BRIN, terutama yang belum mahir dalam mengoperasikan program komputer berbasis command-line. Platform ini dapat bekerja di atas klaster high-performance computing (HPC) milik BRIN untuk memanfaatkan fitur komputasi paralel yang disediakan oleh NVIDIA GPU. Komputasi paralel berperan signifikan dalam mengakselerasi proses pemodelan molekuler tertentu yang membutuhkan resource besar. Di dalam platform ini, kami akan mengembangkan beberapa pipeline pemodelan molekuler sesuai dengan studi kasus dan kebutuhan periset. Pipeline-pipeline ini akan dibangun menggunakan rangkaian tools-tools open source untuk memastikan operasional platform tidak terkendala oleh lisensi. Saat ini sudah ada dua pipeline yang tersedia dan dapat digunakan oleh para periset di lingkungan BRIN, yakni pipeline Molecular Docking dan Molecular Dynamics. Keduanya dikhususkan untuk studi kasus interaksi antara Protein dan Ligand.

2024-1727882531-plqy

B-24937/III.6.5/TK.11.01/10/2024


( Lihat )

Pusat Riset Komputasi

ihsa003@brin.go.id

Badan Riset dan Inovasi Nasional

SF - Perangkat Lunak

Kabupaten Bogor

30 September 2024

EC002024244181

05 Desember 2024

05 Desember 2024

000816613

  • Ihsan Nugraha
    ( Pusat Riset Komputasi )
  • Maulida Mazaya
    ( Pusat Riset Komputasi )
  • Ratna Surya Alwi
    ( Pusat Riset Komputasi )
  • Sahid Bismantoko
    ( Pusat Riset Komputasi )
  • Stevry Yushady CH Bissa
    ( Pusat Riset Komputasi )
  • Rifki Sadikin
    ( Pusat Riset Komputasi )
Kembali